对非法生产、销售合格烟草专卖品和非法生产、销售假冒伪劣烟草专卖品并存时的案件，应当认定行为人实施了两个独立的行为。对这两个独立的行为是否构成犯罪、以一罪处理还是数罪并罚，需要具体分析。第一，非法生产、销售合格烟草专卖品数额未达到定罪标准而非法生产、销售假冒伪劣烟草专卖品构成犯罪的，如果非法生产、销售假冒伪劣烟草专卖品行为不以非法经营罪定罪的，将非法生产、销售合格烟草专卖品作为从重量刑情节考虑，如果以非法经营罪论处的，则应当累计两种行为的数额以非法经营罪定罪处罚；第二，非法生产、销售合格烟草专卖品构成非法经营罪，非法生产、销售假冒伪劣烟草专卖品数额未达到定罪标准的，累计两种行为的数额以非法经营罪定罪处罚；第三，非法生产、销售合格烟草专卖品构成非法经营罪，非法生产、销售假冒伪劣烟草专卖品也构成犯罪的，
如果非法生产、销售假冒伪劣烟草专卖品行为也以非法经营罪定罪的，累计两种行为的数额以非法经营罪定罪处罚，否则，以非法经营罪与他罪并罚；第四，非法生产、销售合格烟草专卖品和非法生产、销售假冒伪劣烟草专卖品数额均未达到定罪标准均不构成犯罪，但累计两种行为的数额后构成非法经营罪的，以非法经营罪定罪处罚。